Домен в Апаче надо записывать не как он есть (домен.рф), а в punicode. Чтобы перекодировать можно воспользоваться следующим сайтом:
» Нажмите, для открытия спойлера | Press to open the spoiler «
Домен.рф в пуникоде будет xn--d1acufc.xn--p1ai
Т.е. в Апаче прописываем ServerName xn--d1acufc.xn--p1ai
...