Топикстартер не указал для каких целей ему нужен новый винчестер и на какой модели он остановил свой выбор.
Вичестеры SATA3 прекрасно работают с материнками поддерживающими SATA2. Разницу в скорости портов для простого пользователя будет не особо незаметна или даже вообще не заметна, потому как скорость работы механики осталась неизменной, также как и скорость чтения головок с блинов. Увеличивается только скорость обмена информацией между кэшем винчестера и шиной. Собственно на субъективное восприятие скорости работы винчестера больше влияет размер кэша, чем он больше тем "быстрее" работает система.
Предложу свой вариант отказоустойчивого винчестера, я для себя выбрал Seagate Constellation ES, модель ST1000NM0033.
Наблюдаю за парой десятков таких, установленных на работе и парой установленных в домашнем компе. Винты достаточны быстрые и надёжные, правда немного шумноваты, но и предназначены они в основном не для домашнего использования.
Если позволяет бюджет, это был бы самый оптимальный вариант для настольного ПК.